Yu-Gi-Oh! O Lado Negro das Dimensões

Seis meses após os eventos do mangá original de Yu-Gi-Oh!, Yugi Muto e seus amigos estão no último ano do ensino médio e conversam sobre seus planos para o futuro. Embora Yugi ainda sinta que perdeu uma parte de si mesmo, ele se conformou com o fato de que o Faraó não está mais com ele. No entanto, outras pessoas podem não estar dispostas a deixar o passado de lado. Seto Kaiba encomendou uma escavação para recuperar o Enigma do Milênio, o item já havia abrigado a alma de seu rival, Atem, que ele espera reviver para acertar as contas. Mas, a escavação é interrompida por um misterioso estranho chamado Aigami, que detém o poder sobre as dimensões.